一是流通領(lǐng)域條塊分割，缺乏統一的管理。長(cháng)期以來(lái)，我國貿易分為內貿與外貿，這種體制適應了我國計劃經(jīng)濟的要求，雖然在長(cháng)期短缺經(jīng)濟和封閉經(jīng)濟條件下，這種體制發(fā)揮了重要的作用。但是，隨著(zhù)我國改革開(kāi)放的深入，這種體制的弊端越來(lái)越顯現出來(lái)，它嚴重桎梏和阻礙著(zhù)全國統一的市場(chǎng)經(jīng)濟的發(fā)展。同時(shí)我國國內貿易也處于條塊分割的狀況，農產(chǎn)品、工業(yè)消費品、生產(chǎn)資料、再生資料、生活性服務(wù)、生產(chǎn)性服務(wù)、信息服務(wù)等商品流通相互分割，政府流通職能部門(mén)分割，形成商品流通領(lǐng)域11個(gè)部門(mén)分管，沒(méi)有一個(gè)主導的流通宏觀(guān)調控部門(mén)，不利于統一、開(kāi)放、競爭、有序、安全的市場(chǎng)體系的形成，也不利于統一的現代流通產(chǎn)業(yè)發(fā)展。
二是流通組織結構不合理，呈現小散亂弱的狀況。（1）流通企業(yè)規模相對較小且松散。我國流通產(chǎn)業(yè)中小企業(yè)所占比例為99%以上，企業(yè)規模呈現小、散、亂、弱的狀態(tài)，企業(yè)擴大規模的方式主要是單體擴張，限制了企業(yè)規模的發(fā)展，同時(shí)也導致了產(chǎn)業(yè)集中度低。而國外流通企業(yè)大多采取連鎖經(jīng)營(yíng)的方式來(lái)擴大企業(yè)規模，我國連鎖經(jīng)營(yíng)規模僅占社會(huì )消費品零售總額的10%多一點(diǎn)，需要大力發(fā)展連鎖經(jīng)營(yíng)。（2）流通企業(yè)之間關(guān)聯(lián)性差，組織結構松散。發(fā)達國家的流通企業(yè)間關(guān)聯(lián)性主要體現在企業(yè)所有權的集中度較高，大企業(yè)通過(guò)參股、控股乃至收購等手段，以資本為紐帶，把大量中小企業(yè)納入自己的協(xié)作范圍，以一個(gè)大公司為核心，組建規模巨大的企業(yè)集團，形成穩定的市場(chǎng)供應鏈。而我國企業(yè)之間的市場(chǎng)聯(lián)系僅僅局限于簡(jiǎn)單的供求關(guān)系，且缺乏“長(cháng)期交易”行為，不同的行業(yè)、企業(yè)、地域之間條塊分割、地區封鎖，導致企業(yè)組織結構松散。（3）流通網(wǎng)點(diǎn)分布不合理，組織結構差異性較大。20世紀90年代以來(lái)，從國外引進(jìn)的超市、折扣店、大賣(mài)場(chǎng)等新型業(yè)態(tài)主要集中在少數行業(yè)和東部沿海大中城市，經(jīng)濟不發(fā)達的中西部地區相對滯后，使流通產(chǎn)業(yè)發(fā)展顯得不均衡。
三是流通產(chǎn)業(yè)信息化程度較低。（1）流通產(chǎn)業(yè)的信息水平較低。在計算機和網(wǎng)絡(luò )時(shí)代，我國許多流通企業(yè)的信息建設相對滯后，許多企業(yè)的信息尚處于起步階段，技術(shù)裝備不足，人才缺乏且結構不合理。主要表現為：信息管理機構不健全、信息管理不規范、信息處理和傳輸手段落后、信息工作人員技術(shù)素質(zhì)低等。（2）信息化投入不足。目前我國流通企業(yè)用于信息技術(shù)和裝備方面的投資僅占總資產(chǎn)的0.3%，而美國已經(jīng)達到10%以上，相比較差距較大。（3）網(wǎng)絡(luò )營(yíng)銷(xiāo)不充分。目前80%的流通企業(yè)從形式上都接入了互聯(lián)網(wǎng)，但大多數企業(yè)只是在網(wǎng)站上建立了一個(gè)網(wǎng)頁(yè)而已，沒(méi)有充分利用網(wǎng)絡(luò )資源；絕大多數大中城市都普及了POS系統，但沒(méi)有充分發(fā)揮信息管理功能。
四是流通經(jīng)營(yíng)方式落后和觀(guān)點(diǎn)落后。許多流通企業(yè)主要采取低價(jià)競爭策略，許多先進(jìn)的經(jīng)營(yíng)方式?jīng)]有采用。如遠期交易、期貨交易、代理經(jīng)營(yíng)、信用交易、網(wǎng)上交易、租賃經(jīng)營(yíng)、物流配送、連鎖經(jīng)營(yíng)，以及多種現代流通科技發(fā)展還很不夠。許多流通企業(yè)缺乏以顧客為中心、參與市場(chǎng)競爭、注重企業(yè)形象等經(jīng)營(yíng)理念，而這卻是21世紀市場(chǎng)競爭最需要的。
五是流通國際化程度較低。改革開(kāi)放以來(lái)，雖然我國餐飲業(yè)、批發(fā)市場(chǎng)走出國門(mén)，但是我國大型流通企業(yè)“走出去”參與世界競爭的較少，個(gè)別走出去的零售企業(yè)還具有某種政府行為，因此效果并不很好，流通企業(yè)應按市場(chǎng)經(jīng)濟規律走出去，參與國際市場(chǎng)競爭。在內外貿行政管理機構合并后，許多國內貿易企業(yè)還沒(méi)有充分利用外貿企業(yè)的國際銷(xiāo)售渠道優(yōu)勢，參與市場(chǎng)競爭。
六是流通產(chǎn)業(yè)在加快經(jīng)濟運轉方面的作用沒(méi)有充分發(fā)揮。我國流通企業(yè)資金周轉率較發(fā)達國家相比差距較大，據資料表明，2003年我國大型流通企業(yè)流動(dòng)資金周轉速度僅為2.3次，而發(fā)達國家流通企業(yè)資金周轉速度達到20次以上。2005年全國商品庫存1.8萬(wàn)億元，累計在3萬(wàn)~4萬(wàn)億元，其中流通企業(yè)的庫存也在增加。社會(huì )庫存大量增加，增加了產(chǎn)成品資金占用和經(jīng)營(yíng)成本，導致企業(yè)效益下滑；相互欠款和呆壞賬增加，導致社會(huì )資金周轉速度下降。
七是中國離貿易強國的距離較大。我國是制造業(yè)能力較強，是世界制造業(yè)中心，但交易能力、定價(jià)能力較弱，不是貿易中心、營(yíng)銷(xiāo)中心、采購中心、物流中心。因為我國處于“微笑曲線(xiàn)”低端，加上流通力較弱，只能拿到一小部分利益，在國際交換中處于分工的低端。從出口來(lái)看，我國現已是出口大國，但是不是出口強國，沒(méi)有出口價(jià)格的定價(jià)權。